R与JAVA的整合

R是统计计较的强大东西，而Java是做应用系统的主流语言，两者天然具有整合的需要。关于整合，一方面，R中可以建设JAVA工具挪用JAVA要领，另一方面，JAVA中可以转换R的数据范例挪用R的函数，相互取长补短。此刻也有一个项目JGR，用JAVA做R的图形界面，可以实现高亮显示自动补全等，还能让JAVA和R相互挪用。

　　关于R中挪用JAVA，我想主要是为了操作其面向工具的特性，究竟R语言迩来很致力于向面向工具成长，有个很好的项目rJava可以实现，在www.rforge.net/rJava上。R中调JAVA对我好像意义不大，本文主要先容JAVA中挪用R。所有测试都在Windows XP、R2.10.1和JDK1.6下完成。

　　JAVA很适合开拓应用系统，可是数学建模和计较本领非其所长，假如该系统需要举办大量的统计可能优化的计较，挪用R是一种很好的方法。JAVA认真系统的构建，R用来做运算引擎，从而实现应用型和阐明性相团结的系统。

　　首先要先容的是Rserve的方法，这是一个基于TCP/IP的处事器，通过二进制协议传输数据，可以提供长途毗连，使得客户端语言可以或许挪用R。今朝Rserve作为一个package宣布在CRAN上，可以直接利用install.packages(“Rserve”)举办安装。需要利用时在R节制台下加载该包，然后输入呼吁Rserve()，开启处事器，就可以供客户端挪用。

　　其客户端可以有多种，这里只先容JAVA客户端。最早的客户端包是JRclient，在www.rosuda.org/Rserve上还可以下载到，可是此刻该项目全部移到了www.rforge.net/Rserve，利用REngine作客户端（和JRI一致），在该网站下可以下载到REngine.jar和RserveEngine.jar两个文件。假如用eclipse开拓的话，在工程属性中导入这两个外部的jar包，就可以正常利用了。

　　一个简朴的例子：

public class rtest {

　　public static void main(String[] args) throws REXPMismatchException,　REngineException {

  　　RConnection c = new RConnection();

  　　REXP x = c.eval(“R.version.string”);

  　　System.out.println(x.asString());

　　}

}

首先成立一个新的毗连，然后就可以利用eval之类的要领将R中的表达式传随处事器端，通过R求值后传回JAVA中REXP范例的变量，然后打印出来，整个进程很是简朴。由于不需要对R举办初始化，因此速度会较量快。在其他系统下可以同时成立多个毗连，可是在Windows下只答允同时打开一个毗连，后续的毗连城市共有沟通的定名空间。官网上不发起在Windows下利用Rserve，因为会丧失许多机能，他们推荐可以思量DCOM的方法。不外DCOM谁人工程没有现成的jar包可用，其实假如是拿R做阐明系统中的运算引擎，单毗连够用了。
　　另一种方法是JRI，全名是Java/R Interface，这是一种完全差异的方法，通过挪用R的动态链接库从而操作R中的函数等。今朝该项目已经成了rJava的子项目，不再提供单独的JRI的版本。因此利用时简朴地通过install.packages(“rJava”)安装rJava就行，在安装文件夹中，可以看到一个jri的子文件夹，内里有自带的例子可以用来测试。
　　装好后要修改系统的情况变量，在PATH中添加%R_HOME%bin和%R_HOME%libraryrJavajri，留意R_HOME的路径要正确，重启系统使之生效。利用时同样在eclipse里导入外部的jar包（在www.rforge.net/rJava下载JRI.jar、REngine.jar和JRIEngine.jar这三个文件），在rJava包安装目次下的jriexamples里有现成的例子（rtest.java和rtest2.java），可以测试是否乐成。
　　之前我的电脑上一直存在一个很奇怪的问题，测试第一个例子时在“Creating Rengine (with arguments)”的时候就愣住了，第二个例子中一个JAVA框很快闪一下就消失了，节制台中没有任何提示。打开JGR也是一闪即逝。在网上查了好久，只有一个印度哥们也碰着过雷同的问题，并且没有找到办理步伐。预计应该是实现RMainLoopCallbacks时出了问题，可是找不到原因，厥后卸载了R2.9.0重装了R2.10.1，而且通过install.packages安装，终于没问题了，大概是主措施和Package之间的版本斗嘴，以跋文住全部用install.packages来安装package了。
　　关于客户端处事器的方法和动态链接库的方法，各有所长，凭据需要选用。小我私家履历，不管利用哪种方法，设计时只管少举办频繁的数据的交互，在逻辑上把系统和计较分隔，使得R成为一个纯粹的运算引擎。