使用R MARKDOWN编辑文档

Markdown基本格式

使用Pandoc的Markdown格式化R Markdown文件中的文本，Markdown是一组纯文本文件的标记注释。渲染文件时，Pandoc会将标记的文本转换为最终文件格式的格式化文本：

您可以使用Pandoc的Markdown来制作：

• Head标题

• list 列表

• 链接

• 图片

• Block quotes

• Latex的公式

• 横向规则

• 表

• 脚注

• 参考书目和引文

• Slide breaks

• 斜体文字

• 加粗字体

• 上标

• 标

• 删除线文字

不过我这里还有一些标准的markdown书写规则手册可以查看下面：

行内HTML

Markdown的语法有个主要的目的：用来作为一种网路内容的写作用语言。

Markdown不是要来取代HTML，甚至也没有要和它相似，它的语法种类不多，只和HTML的一部分有关系，重点不是要创造一种更容易写作HTML文件的语法，我认为HTML已经很容易写了，Markdow的重点在于，它能让文件更容易阅读、编写。HTML是一种发布的格式，Markdown是一种编写的格式，因此，Markdown的格式语法只涵盖纯文字可以涵盖的范围。

不在Markdown涵盖范围之外的标签，都可以直接在文件里面用HTML撰写。不需要额外标注这是HTML或是Markdown；只要直接加标签就可以了。

只有区块元素──比如<div>、<table>、<pre>、<p>等标签，必需在前后加上空行，以利与内容区隔。而且这些（元素）的开始与结尾标签，不可以用tab或是空白来缩排。Markdown的产生器有智慧型判断，可以避免在区块标签前后加上没有必要的<p>标签。

举例来说，在Markdown文件里加上一段HTML表格：

This is a regular paragraph.

<table>
    <tr>
        <td>Foo</td>
    </tr>
</table>

This is another regular paragraph.

请注意，Markdown语法在HTML区块标签中将不会被进行处理。例如，你无法在HTML区块内使用Markdown形式的*強調*。

HTML的区段标签如<span>、<cite>、<del>则不受限制，可以在Markdown的段落、清单或是标题里任意使用。依照个人习惯，甚至可以不用Markdown格式，而采用HTML标签来格式化。举例说明：如果比较喜欢HTML的<a>或<img>标签，可以直接使用这些标签，而不用Markdown提供的连结或是影像标示语法。

HTML区段标签和区块标签不同，在区段标签的范围内，Markdown的语法是有效的。

特殊字元自动转换

在HTML文件中，有两个字元需要特殊处理：<和&。<符号用于起始标签&符号则用于标记HTML实体，如果你只是想要使用这些符号，你必须要使用实体的形式，像是<和&。

&符号其实很容易让写作网路文件的人感到困扰，如果你要打「AT&T」 ，你必须要写成「AT&T」 ，还得转换网址内的&符号，如果你要连结到：

http://images.google.com/images?num=30&q=larry+bird

你必须要把网址转成：

http://images.google.com/images?num=30&q=larry+bird

才能放到连结标签的href属性里。不用说也知道这很容易忘记，这也可能是HTML标准检查所检查到的错误中，数量最多的。

Markdown允许你直接使用这些符号，但是你要小心跳脱字元的使用，如果你是在HTML实体中使用&符号的话，它不会被转换，而在其他情形下，它则会被转换成&。所以你如果要在文件中插入一个著作权的符号，你可以这样写：

©

Markdown将不会对这段文字做修改，但是如果你这样写：

AT&T

Markdown就会将它转为：

AT&T

类似的状况也会发生在<符号上，因为Markdown支援行内HTML，如果你是使用<符号作为HTML标签使用，那Markdown也不会对它做任何转换，但是如果你是写：

4 < 5

Markdown将会把它转换为：

4 < 5

不过需要注意的是，code范围内，不论是行内还是区块，<和&两个符号都一定会被转换成HTML实体，这项特性让你可以很容易地用Markdown写HTML code（和HTML相对而言。在HTML语法中，你要把所有的<和&都转换为HTML实体，才能在HTML文件里面写出HTML code。）

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区块元素

段落和换行

一个段落是由一个以上相连接的行句组成，而一个以上的空行则会切分出不同的段落（空行的定义是显示上看起来像是空行，便会被视为空行。比方说，若某一行只包含空白和tab，则该行也会被视为空行），一般的段落不需要用空白或断行缩排。

「一个以上相连接的行句组成」这句话其实暗示了Markdown允许段落内的强迫断行，这个特性和其他大部分的text-to-HTML格式不一样（包括MovableType的「Convert Line Breaks」选项），其他的格式会把每个断行都转成<br />标签。

如果你真的想要插入<br />标签的话，在行尾加上两个以上的空白，然后按enter。

是的，这确实需要花比较多功夫来插入<br />，但是「每个换行都转换为<br />」的方法在Markdown中并不适合， Markdown中email式的区块引言和多段落的清单在使用换行来排版的时候，不但更好用，还更好阅读。

标题

Markdown支援两种标题的语法，Setext和atx形式。

Setext形式是用底线的形式，利用=（最高阶标题）和-（第二阶标题），例如：

This is an H1
=============

This is an H2
-------------

任何数量的=和-都可以有效果。

Atx形式则是在行首插入1到6个#，各对应到标题1到6阶，例如：

# This is an H1

## This is an H2

###### This is an H6

你可以选择性地「关闭」atx样式的标题，这纯粹只是美观用的，若是觉得这样看起来比较舒适，你就可以在行尾加上#，而行尾的#数量也不用和开头一样（行首的井字数量决定标题的阶数）：

# This is an H1 #

## This is an H2 ##

### This is an H3 ######

区块引言

Markdown使用email形式的区块引言，如果你很熟悉如何在email信件中引言，你就知道怎么在Markdown文件中建立一个区块引言，那会看起来像是你强迫断行，然后在每行的最前面加上>：

> This is a blockquote with two paragraphs. Lorem ipsum dolor sit amet,
> consectetuer adipiscing elit. Aliquam hendrerit mi posuere lectus.
> Vestibulum enim wisi, viverra nec, fringilla in, laoreet vitae, risus.
> 
> Donec sit amet nisl. Aliquam semper ipsum sit amet velit. Suspendisse
> id sem consectetuer libero luctus adipiscing.

Markdown也允许你只在整个段落的第一行最前面加上>：

> This is a blockquote with two paragraphs. Lorem ipsum dolor sit amet,
consectetuer adipiscing elit. Aliquam hendrerit mi posuere lectus.
Vestibulum enim wisi, viverra nec, fringilla in, laoreet vitae, risus.

> Donec sit amet nisl. Aliquam semper ipsum sit amet velit. Suspendisse
id sem consectetuer libero luctus adipiscing.

区块引言可以有阶层（例如：引言内的引言），只要根据层数加上不同数量的>：

> This is the first level of quoting.
>
> > This is nested blockquote.
>
> Back to the first level.

引言的区块内也可以使用其他的Markdown语法，包括标题、清单、程式码区块等：

> ## This is a header.
> 
> 1.   This is the first list item.
> 2.   This is the second list item.
> 
> Here's some example code:
> 
>     return shell_exec("echo $input | $markdown_script");

任何标准的文字编辑器都能简单地建立email样式的引言，例如BBEdit，你可以选取文字后然后从选单中选择增加引言阶层。

清单

Markdown支援有序清单和无序清单。

无序清单使用星号、加号或是减号作为清单标记：

*   Red
*   Green
*   Blue

等同于：

+   Red
+   Green
+   Blue

也等同于：

-   Red
-   Green
-   Blue

有序清单则使用数字接着一个英文句点：

1.  Bird
2.  McHale
3.  Parish

很重要的一点是，你在清单标记上使用的数字并不会影响输出的HTML结果，上面的清单所产生的HTML标记为：

<ol>
<li>Bird</li>
<li>McHale</li>
<li>Parish</li>
</ol>

如果你的清单标记写成：

1.  Bird
1.  McHale
1.  Parish

或什至是：

3. Bird
1. McHale
8. Parish

你都会得到完全相同的HTML输出。重点在于，你可以让Markdown文件的清单数字和输出的结果相同，或是你懒一点，你可以完全不用在意数字的正确性。

如果你使用懒惰的写法，建议第一个项目最好还是从「1.」开始，因为Markdown未来可能会支援有序清单的start属性。

清单项目标记通常是放在最左边，但是其实也可以缩排，最多三个空白，项目标记后面则一定要接着至少一个空白或tab。

要让清单看起来更漂亮，你可以把内容用固定的缩排整理好：

*   Lorem ipsum dolor sit amet, consectetuer adipiscing elit.
    Aliquam hendrerit mi posuere lectus. Vestibulum enim wisi,
    viverra nec, fringilla in, laoreet vitae, risus.
*   Donec sit amet nisl. Aliquam semper ipsum sit amet velit.
    Suspendisse id sem consectetuer libero luctus adipiscing.

但是如果你很懒，那也不一定需要：

*   Lorem ipsum dolor sit amet, consectetuer adipiscing elit.
Aliquam hendrerit mi posuere lectus. Vestibulum enim wisi,
viverra nec, fringilla in, laoreet vitae, risus.
*   Donec sit amet nisl. Aliquam semper ipsum sit amet velit.
Suspendisse id sem consectetuer libero luctus adipiscing.

如果清单项目间用空行分开， Markdown会把项目的内容在输出时用<p>标签包起来，举例来说：

*   Bird
*   Magic

会被转换为：

<ul>
<li>Bird</li>
<li>Magic</li>
</ul>

但是这个：

*   Bird

*   Magic

会被转换为：

<ul>
<li><p>Bird</p></li>
<li><p>Magic</p></li>
</ul>

清单项目可以包含多个段落，每个项目下的段落都必须缩排4个空白或是一个tab：

1.  This is a list item with two paragraphs. Lorem ipsum dolor
    sit amet, consectetuer adipiscing elit. Aliquam hendrerit
    mi posuere lectus.

    Vestibulum enim wisi, viverra nec, fringilla in, laoreet
    vitae, risus. Donec sit amet nisl. Aliquam semper ipsum
    sit amet velit.

2.  Suspendisse id sem consectetuer libero luctus adipiscing.

如果你每行都有缩排，看起来会看好很多，当然，再次地，如果你很懒惰，Markdown也允许：

*   This is a list item with two paragraphs.

    This is the second paragraph in the list item. You're
only required to indent the first line. Lorem ipsum dolor
sit amet, consectetuer adipiscing elit.

*   Another item in the same list.

如果要在清单项目内放进引言，那>就需要缩排：

*   A list item with a blockquote:

    > This is a blockquote
    > inside a list item.

如果要放程式码区块的话，该区块就需要缩排两次，也就是8个空白或是两个tab：

*   A list item with a code block:

        <code goes here>

当然，项目清单很可能会不小心产生，像是下面这样的写法：

1986. What a great season.

换句话说，也就是在行首出现数字－句点－空白，要避免这样的状况，你可以在句点前面加上反斜线。

1986\. What a great season.

程式码区块

和程式相关的写作或是标签语言原始码通常会有已经排版好的程式码区块，通常这些区块我们并不希望它以一般段落文件的方式去排版，而是照原来的样子显示，Markdown会用<pre>和<code>标签来把程式码区块包起来。

要在